وی که به روز جمعه با یک گروه از خبرنگاران در مقر وزارت دفاع امریکا در واشنگتن صحبت می‎کرد افزود که نیرو‌های ضد تروریزم امریکا صد‌ها عملیات را در سال جاری میلادی علیه القاعده و داعش در افغانستان راه اندازی کردند.
وی گفت:" آنها بیش از ۳۵۰ عملیات را بر ضد القاعده و گروه داعش در سال ۲۰۱۶ به راه انداختند. نزدیک به پنجاه رهبر، تسهیل کننده و عضو ارشد القاعده و شاخه القاعده در شبه قاره هند کشته و یا بازداشت شده‌اند. علاوه بر آن حدود دو صد عضو دیگر القاعده و گروه داعش نیز کشته و یا گرفتارشده‌اند."
به گزارش رادیو آزادی، نیکلسن گفت که امریکا در تلاش‌های ضد تروریزم مشخصاً روی هدف قراردادن القاعده و داعش تمرکز کرده‌است، وی علاوه کرد که در عملیات نظامی بر ضد داعش ۱۲ رهبر ارشد هسته این گروه در افغانستان به شمول حافظ سعید در سال جاری کشته شدند.
جان نیکلسن گفت، در حالیکه یک زمان پناهگاه‌های داعش در ۹ ولسوالی افغانستان موجود بود حالا به سه ولسوالی کاهش یافته است.