ساکنان پاکستان,هند و بنگلدیش را نه کاهش منابع آب بلکه آلودگی آب با فاضلات سمی تهدید میکند.در حدود 60 فیصد آب های زیر زمینی تا عمق 200 متر درحوضه رود سند,گنگ و براهماپوترا حاوی علظت غیر طبیعی بالا از نمک ها و آرسنیک است. موجودیت چنین مواد آنرا غیر مناسب برای نوشیدن و کشاورزی میسازد.
مشاهدات ماهواره ای نشان داده است که سطح آبهای زیر زمینی کاهش میابد.این شرلیط یکی از تهدیدهای اصلی برای جمعیت که در شبه قاره زندگی میکنند شمرده میشد.