پیام رهبر ایران که در پایگاه اطلاع رسانی دفتر مقام معظم رهبری این کشور منتشر شده، به این شرح است:
بسم الله الرحمن الرحیم
حادثه تلخ و مصیبت‌بار انفجار در مسجد منطقه خان‌آباد استان قندوز که به جان‌باختن جمع زیادی از مؤمنان نمازگزار انجامید، ما را داغدار کرد.
از مسئولان کشور همسایه و برادر افغانستان جداً انتظار می رود که عاملان خونخوار این جنایت بزرگ را به مجازات برسانند و با تدابیر لازم از تکرار چنین فجایعی جلوگیری کنند.
از خداوند متعال رحمت و علوّ درجه برای شهیدان این حادثه و شفای عاجل برای آسیب‌دیدگان و صبر و سکینه برای کسان و بازماندگان آنها مسألت می کنم.
سیّدعلی خامنه‌ای
۱۷ مهر/میزان ۱۴۰۰
۱۷ مهر/میزان ۱۴۰۰